院内设置软科学研究室、信息资源研究室、信息技术研究室、统计信息中心、现代物流研发中心、标准技术室、计量技术室、环境保护研究室、国家船舶舱容积计量站、交通技术交易中心、交通技术咨询中心、交通技术培训中心等部门和一个直属机构——上海河口海岸科学研究中心。

院投资的全资或控股公司主要有：北京绿茵达绿化工程技术公司、北京华运展科技发展中心、北京交通科技咨询服务公司、北京交科新材料技术公司、北京荣瑞达智能交通技术有限责任公司、北京海威交通仪器有限公司等。

业务范围

●承担交通行业有关软科学研究。包括行业前瞻性发展战略研究，行业性法规和政策研究，行业发展重点、热点问题的决策支持研究，重担项目的预评估和后评价等。

●开展交通信息资源开发、建设和服务。包括交通文献资源的采集、加工、储存及服务；交通电子图书馆、有关信息库及网上信息资源开发、建设和服务。

●开展交通信息化技术研究。包括物流信息技术、信息服务支持技术、交通应用信息基本系统等的研究开发、信息传媒技术研究和开发、信息化标准、规范研究等。

●开展交通行业标准化研究。包括研究行业标准化基础理论、技术政策、承担制定和修订交通行业的国家和行业标准项目；进行技术标准的宣贯和推广。

●开展交通行业环境保护技术及政策研究。包括环境事故应急反应技术研究，交通环境保护对策利用就，环境再造工程技术研究，噪声等污染防治技术研究，环境检测技术研究，国内外环境保护技术分析，ISO14000系列标准宣贯等。

●开展交通行业统计数据处理、统计资料编辑、统计分析、统计理论研究、参与港口、公路普查等统计调查，协助指定统计报表制度、统计信息系统建设等。

●开展物流技术与产品研究，全面推进信息技术在现代物流领域的应用及市场拓展，推动综合物流信息网建设，提高交通行业的物流建设与管理水平。

●承担河口海岸通航条件的科学试验。为长江全线和国内外海岸、河口的整治工作和港口航道的建设提供技术服务，为其他相关工程可科研项目提供技术服务。

●承担交通行业计量技术研究。负责公路工程仪器计量检定站和国家船舶舱容计量站的工作。

●开展交通行业中介和科技服务。一社会效益为主的技术交易服务和行业科技成果的推广应用、信息服务、专利服务、技术咨询、技术培训、技术检测、研究试验、项目评估、质量监督、环境检测等社会中介和公共服务。

●承办行业国际科技交流活动，承担行业内部的技术创新交流活动；承担行业知识产权的保护、推广和实施工作；承当科研项目的查新和成果的专利申报管理工作等。